工程保函是指由银行或担保公司出具的，保证承建商在工程项目中履行合同义务的书面保证方式。承建商通常需要向业主提供工程保函作为履约担保，以确保项目能够按合同要求进行。
工程保函的一个明显缺点是高额的费用。银行或担保公司在提供保函时会收取一定比例的手续费，这对于承建商来说可能增加了项目的成本负担。特别是在一些大型工程项目中，保函费用可能相当昂贵。
另一个工程保函的缺点是它可能对承建商的借贷能力产生限制。承建商向银行申请贷款时，工程保函作为一种担保方式被考虑在内，这意味着承建商的信用额度可能受到一定限制，影响到其其他贷款需求。
工程保函还可能增加承建商的资金压力。在提供工程保函之前，银行通常会要求承建商提供一定比例的存款作为担保，这可能占用承建商的现金流，并给其带来资金压力。
工程保函给予了业主更多的保障，但也意味着承建商必须承担更多的风险责任。如果项目出现问题或无法按时完成，承建商可能面临违约责任，而需要承担相应的经济损失。
工程保函对承建商的选择范围产生了一定限制。由于保函要求一定的信用背景和资金实力，较小规模或新兴的承建商可能无法满足条件，从而无法获得重要工程项目的机会。
最后，工程保函可能导致项目的总体成本增加。虽然保函确保了项目的履约，但承建商需要支付手续费、存款等费用，这会使项目的总成本增加，进而影响到整体利润。
