工程保函和银行保函是经济活动中常见的两种担保方式，它们在用途、性质、承担主体以及申请流程等方面存在一些差异。
工程保函通常用于工程建设项目中，作为业主（招投标方）要求承包商提供的担保手段。而银行保函则常用于借款、信用、合同履行等其他领域。
工程保函属于特殊保函，是对施工单位履约能力、工程质量等进行担保的方式。银行保函则是一种金融担保工具，以银行信誉作为支撑，对合同履行等进行担保。
工程保函的发出主体一般是保险公司或担保公司；接收方是工程业主（招投标方）。而银行保函的发出主体是银行，接收方则是债权人或其他合同相关方。
申请工程保函需要提供项目信息、承包商资质、担保费用等材料，并进行业主审核。而银行保函的申请一般需要提供合同、借款或信用需求等相关文件，通过与银行洽谈后完成。
工程保函的费用通常较高，因为涉及到施工风险和质量问题。而银行保函的费用相对较低，以银行的信誉为基础进行担保，风险较小。
工程保函的期限一般与工程项目周期相对应，例如竣工验收后解除。而银行保函的期限一般根据合同的约定，可以是短期的，也可以是长期的。
工程保函存在工程项目无法完成、工程质量不符合要求等风险。银行保函则存在债务人不履行还款义务、违约等风险。
