工程预付款保函是指建筑施工合同中，承包商要求施工单位提供的一种金融担保。它的目的是确保工程的预付款在发生违约或工程质量问题时能够退还给业主，以保证业主的利益不受损失。
保证金是工程预付款保函中的一项重要内容。它是由承包商在签订合同时向业主交纳的一笔金额，用于作为解决违约情况下的经济赔偿或其他纠纷处理方式。保证金的存在可以增加合同履行方的责任意识，降低合同风险，促使双方在工程合同中更加慎重和诚实地履行合同条款。
保证金的数额通常是根据合同总价的一定比例来确定，一般为3%到10%之间。支付方式有两种，一种是一次性支付，即在合同签订后，承包商需要立即向业主支付全额保证金；另一种是分期支付，即按照工程建设进度的不同阶段，承包商需要逐步地支付相应比例的保证金。
在工程项目完成后，如果双方没有发生违约或纠纷，那么保证金将会在合同规定的时间内全额退还给承包商。但如果出现违约、质量问题等情况，业主有权根据合同条款，从保证金中扣除相应金额作为赔偿或处罚。
工程预付款保函并不是所有情况下都需要提供保证金。根据合同的具体条款和双方协商，如果业主能够信任承包商的信誉和实力，也可以免除提供保证金的要求。不过这种情况相对较少，通常是在与承包商有长期合作关系或双方之间存在其他特殊约定的情况下才会出现。
工程预付款保函作为一种重要的金融担保方式，旨在保障工程质量和维护合同双方的利益。保证金作为其中的一项要求，具有着确保合同履行的重要意义。双方应在签订合同时，详细了解和明确各种费用、保证金等相关事宜，并在合同中明确规定，以避免产生不必要的纠纷和损失。
