履约保证金是指在合同订立或履行过程中，为保证合同双方之间的权益，一方提供给另一方的一定金额的保证金。而银行保函则是指通过银行为保证人向收款人出具的书面承诺，在合同约定的情况下，收款人可向银行主张债权。
履约保证金可以选择由银行出保函，这种做法有以下几个优点：
首先，由银行出保函可以有效减轻买卖双方的风险。在进行商业交易中，买方可能因各种原因无法按时付款，或者卖方无法按时交付商品。这时，如果买方已经支付了履约保证金，并以此申请银行出具保函，那么卖方就可以向银行主张债权，从而获得合理的赔偿。
其次，由银行出保函可以为交易提供更大的信誉保障。在商业交易中，买卖双方往往不太熟悉对方的信用状况，特别是对于新客户来说。通过银行的介入，买方可以通过缴纳履约保证金并申请银行出保函，向卖方证明自己的信用状况，并增加交易成功的可能性。
此外，由银行出保函还可以简化交易流程。在传统的商业交易中，买方需要支付一定金额的履约保证金，并与卖方签订相关文件。然而，有时候签订文件的过程可能较为复杂，甚至需要耗费大量时间和精力。而通过银行出保函，买方只需办理一次手续即可，极大地简化了交易流程。
总之，选择由银行出保函是一种有效的方式来提高商业交易的安全性和信誉度，减轻买卖双方的风险。当然，在实际操作中，买卖双方应该在合同中明确约定履约保证金和银行保函的相关事宜，以便更好地保障自身权益。
