保函是指由担保人（通常为银行、保险公司等）向受益人发出的书面承诺，保证在特定情况下给予一定的支付或履约义务。保函通常用于各类商业活动中，例如投标、履约、预付款等环节。
工程款是指在进行工程项目过程中，合同约定的应支付给承包商、供应商或其他相关方的款项。它涵盖了工程的建设成本、劳务费用以及相关的税费等。
保函在工程款中起到重要的作用。通常，在工程项目的投标阶段，招标方会要求投标人提供一份担保保函，以确保投标人能够按照合同的约定完成工程，并能按时获得应得的工程款。同时，工程进展中也可能需要使用不同类型的保函，如履约保函、付款保函等来保证各方的权益。
保函与工程款存在一定的关系，但并不能将保函视为工程款的一部分。保函是一种担保形式，其目的在于提供信任和保障给工程项目的各方。工程款则是实际支付给承包商等相关方的款项。保函只是作为一种支付保障手段，确保工程进展顺利、资金安全。
工程款的支付方式通常由合同双方协商确定，并根据合同约定进行支付。这可能包括预付款、进度款、尾款等不同的支付阶段和方式。工程款的支付通常需经过严格的审核程序，以确保支付的合法性和有效性。
保函的责任和解除条件应根据具体合同中的约定来执行。一旦发生保函涵盖的事件或情况，保证人有义务履行保函的责任。同时，保函也可能在某些情况下被解除，例如在履约完毕或达到约定条件时。
要保持健康的工程款管理，各方应合理规划资金需求、制定明确的合同条款，并建立有效的监督机制。双方应遵守合同约定，及时支付工程款并确保支付的及时性和准确性。
