工程质量保证金是指承包商在完成工程施工后支付给甲方的一定金额，作为对工程质量问题的担保。
保函缺陷期是指承包商提交保函后，甲方在验收合格后，要求承包商再继续监管一段时间，以确保工程没有隐患或质量问题。
保函缺陷期通常为6个月到1年，视具体合同条款而定。
工程质量保证金保函缺陷期的存在，可以充分保护甲方的利益，确保工程质量问题在一定时期内得到解决。
同时，保函缺陷期也能够促使承包商在该期限内对可能出现的质量问题进行及时修复，从而提高工程质量标准。
在签署合同时，双方应明确保函缺陷期的具体条款和相关责任。
承包商需要清楚了解保函缺陷期开始时间、结束时间以及需要承担的维修责任。
甲方则应注意在保函缺陷期内及时发现和提出工程质量问题，以便及时修复。
在保函缺陷期内发现工程质量问题，甲方可以采取以下方式：
保函缺陷期是承包商对工程质量的最后一次监管，履行期间承包商需积极主动地配合甲方的维修要求，并确保问题得到完全解决。
当保函缺陷期过期后，若仍有工程质量问题出现，甲方将很难追究承包商的责任。
保函缺陷期履行完毕后，甲方应重新对工程进行验收。
若发现工程质量问题已经得到解决，则可以正式接受工程并支付相应款项。
若仍有未解决的工程质量问题，甲方可以继续要求承包商进行修复，或者寻求其他处理方式。
在工程质量保证金保函缺陷期履行完毕后，若双方之间出现争议，可以通过友好协商、调解等方式解决；若无法协商解决，也可以通过仲裁或诉讼途径解决。
